Embora a Retinografia Fluorescente seja geralmente considerada um exame seguro, existem algumas contraindicações e precauções que devem ser observadas. As principais contraindicações estão relacionadas à reação alérgica ao corante de Fluoresceína e a condições médicas pré-existentes, como Insuficiência Renal; a Angiofluoresceinografia Retiniana é geralmente é evitada durante a gravidez, especialmente no primeiro trimestre, enquanto que mulheres que estão amamentando são orientadas a evitar fazê-lo nas primeiras 24 horas após o exame, para reduzir a exposição do bebê ao corante. A alergia conhecida ao Iodo, presente em contrastes utilizados em outros exames de imagem, não é contra-indicação para realização do procedimento.